Også Kvennaneset og Gangstøvika er vurdert.

I vektingen av valg teller økonomi mest, (50 prosent), mens stedlig egnethet teller 30 prosent og miljø 20 prosent. Et deponianlegg på Flatholmen er beregnet å koste 34 mill. kr pluss moms, Kvennaneset øst 54 mill, Kvennaneset vest 32 mill, og Gangstøvika 39 mill.

Blant ulemper på Kvennaneset er planer om blokkbebyggelse og fare for at giftgass kan sive inn i bebyggelsen. I Gangstøvika er ugunstig topografi en av ulempene. Det er Ålesund kommune som har valgt ut alternative plasseringer og gitt Norconsult oppdraget med å utrede disse.